Осторожно спойлер:
Посередине киносюжета оказывается магозоолог Ньют Скамандер, который возвращается в город в 1926 году. Он продолжает свои изыскания колдовских созданий и стремится предохранить их от опасностей, с которыми они сталкиваются в мире людей. Ньют встречается с серьезными трудностями, иногда его старый знакомый Геллерт Гриндельвальд останавливается на пути беспросветной магии и начинает коллекционировать приверженцев для собственных проектов после покорения круга волшебников.
Пока Ньют старается приостановить Гриндельвальда, он встречается с новыми и старыми друзьями, включая волшебников и магозоологов, которые помогают ему в его миссии. Они исследуют всевозможные страны и сталкиваются с разнообразными чародейными существами, которые могут стать как союзниками, так и врагами. Каждый шаг приближает их к раскрытию секретов, связанных с Гриндельвальдом, и они находятся на грани разгадки, однако на горизонте возникают новые угрозы, усложняющие их задачу.
Ситуация усугубляется, и мир начинает раскалываться, и герои понимают, что их действия имеют последствия не только для них, но и для всей колдовской общности. Ньют и его команда должны обнаружить порядок, чтобы справиться с наступающей тьмой и предохранить не только своих друзей, но и мир, в котором они живут. В напряженной гонке с врагом они стараются предотвратить катастрофу, после которой могут произойти необратимые последствия.